題:
有機結構挑戰
Raoul Kessels
2017-12-23 23:32:35 UTC
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最近我們在有機化學部門遇到了這個挑戰。我沒有參與其中,但我認為SE化學站點可能對此很有趣,所以就在這裡。

提出C的結構IUPAC名稱最長的 20 sub> H 18 sub>。適用以下規則:

  1. 名稱必須使用MarvinSketch生成:Structure> Generate Name…>首選IUPAC名稱( https://www.chemaxon.com/products/marvin)。
  2. 不能使用同位素標記。
  3. 結構必須可能(沒有太多不飽和度的循環或沒有不可能的張力的系統)。
  4. 所有字符都將被計數:數字,字母,點,冒號,破折號,所有內容。
  5. 最長名稱勝出。
  6. ol>

    下面是給出的示例:

    enter image description here

    以及提供的名稱作者:MarvinSketch:

    (1' R ,4' Z ,6' Z ,8' Z ,10' Z ,12' S ,15' R ,16' R ,17 ' R )-螺[cyclopropane-1,18'-四環[13 .2.1.04,17.012,16] octadecane] -2,2',4',6',8',10',13'-庚二烯

    141個字符

    祝您2018年吉祥如意!

    編輯

    嗯,沒有獎品是什麼挑戰?最長名稱的賞金價值+50。抱歉,我花不了多少錢。請記住,您可以發布多個結構。如果您提出了一個結構,幾天后您發現一個結構的名稱更長,您也可以發布它。

如何確定最長的?通過字符計數(例如使用等寬字體)或使用比例字體的實際物理長度。如果使用比例字體,哪個?
@mhchem您只是使用HTML標籤而不是使用自己的程序包來編輯公式。我們應該擔心嗎?
@MaxW字符數不帶空格。任何文本編輯器都可以。
@andselisk不,不用擔心。如果只有兩個下標,則可以很好地完成其工作。我希望MathJax字體看起來與文本字體沒有區別,然後我會選擇。
六 答案:
Daniel Bonniot de Ruisselet
2018-01-03 15:24:10 UTC
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$ \ ce {C20H18} $ span>,246個字符

enter image description here

InChI = 1S / C20H18 / c1-2-13(1)5-15(13)7-17(15)9-19(17)11-12(19)20(11)10 -18(20)8-16(18)6-14(16)3-4-14 / h1-4,11-12H,5-10H2 / t11-,12 +,15-,16-,17-, 18-,19-,20- / m1 / s1

PIN :(1'R,1''R,1'''R,1' '''R,1'''''R,1''''''R,2''''R,3''''S)-八氫吡咯[四(環丙烷)-1,2':1 ',2'':1'',2''':1''',4''''-雙環[1.1.0]丁烷2'''',2''''':1'' ''',2'''''':1'''''',2''''''':1''''''',1''''''''-tetrakis(環丙烷)]-2,2''''''''-二烯

這是非常好的。您的方法給了我更多的想法,所以您還不安全! :<
andselisk
2017-12-24 15:20:35 UTC
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$ \ ce {C20H18} $,153個字符

(1'S,2'S,3'R,6'S,8'S)-3'-(cycloprop-2-en-1-yl )-11'-[((環丙-2-烯-1-基)亞甲基]螺[環丙烷-1,7'-三環[6.3.0.02,6]十一烷] -2,4',9'-三烯代碼>

enter image description here


P。 S.我想應該從某個人開始,所以我只使用示例中經過稍微修改的結構。我敢肯定,這將被經驗豐富的有機化學家批評很多,所以它更像是一個開瓶器。

我發現從 Avogadro a開始非常有用>首先繪製(並優化, Ctrl + Alt + O )初始幾何圖形(對於扭曲或類似柏拉圖式實體的幾何圖形非常方便),然後導入 cml 文件

對於想要檢查名稱的人,可以從此處複製名稱,然後按 Ctrl + Shift + N Ctrl + V ,然後在MarvinSketch中單擊 Import 。作為記錄,當前正在使用MarvinSketch 17.29.0。

感謝您的參與!!!我們通常使用ChemDraw,但是由於MarvinSketch是免費的,因此我設置了一個,以便更多的人可以參加。
@RaoulKessels我同意MarvinSketch可能沒有那麼先進,但是它可以完成工作,免費提供,並且幾乎可以在任何地方使用,因此我完全支持您的選擇:)
讓我們開始挑剔;)看來,指向平面的鍵沒有正確放置。
NotEvans.
2017-12-28 01:56:44 UTC
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$ \ ce {C18H20} $ span>:145個字符

我對最長名稱為的異構體感到好奇

實際上是在文獻中報導的,而不是假設地提出的(因此我們至少知道它的存在)。

IUPAC的名稱雖然不如某些示例那麼長,但卻是可敬的145字符,主要是由於立體化學和連通性的表示。

(2aR,4aR,4bS,6aS,8aR,8bS)-1,2,7,8-Tetramethyl-2a,4a,4b,6a-tetrahydrocyclobuta[a]cyclobuta[2',3']cyclopenta[1',2':3,4]cyclobuta[1,2-b]cyclopentene

(2aR,4aR,4bS,6aS ,8aR,8bS)-1,2,7,8-四甲基-2a,4a,4b,6a-四氫環丁[a]環丁[2',3']環戊[1',2':3,4]環丁[ 1,2-b] cyclopentene

該分子在2002年的一篇論文中有所報導( J。Org。Chem。 2002 67 4436-4440)對一組螺[2.4]庚-1,4,6-三烯

的重排
您確定此PIN碼正確嗎?另外,這是$ \ ce {C18H20} $,而不是OP中的$ \ ce {C20H18} $。仍然很有趣,只是運氣不好。
Linear Christmas
2017-12-28 22:33:08 UTC
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這是我輸入的字符數從高到低的順序。我添加了InChI代碼,因為似乎MarvinSketch的名稱讀取能力不及其一代。

1。 $ \ ce {C20H18} $:164個字符

enter image description here

  • InChI = 1 / C20H18 / c1-11-3-4-12(2)17-16-9-15-13(11)5-6-14(15)18(17)20(16)10-19(20)7- 8-19 / h3-6,9,13,15H,1,7-8,10H2,2H3 / b4-3-,17-12 + / t13-,15 +,20- / s2

  • PIN :(2' R ,4'' Z ,7'' S ,11'' S )‐ 3''‐甲基‐6‖‐甲基二烯基螺[雙(環丙烷)‐1,1':2’,14〞 ‐四環[8.4.0.0 2,13 sup> .0 7,11 sup>]十四烷] -1''(10''),2'',4'',8'' ,12''-pentaene

2。 $ \ ce {C20H18} $:167個字符

enter image description here

  • InChI = 1 / C20H18 / c1-11-3-4-12(2)17-16-9-15-13(11)5-6-14(15)18(17)20(16)10-19(20)7- 8-19 / h3-8,14-15,18H,2,9-10H2,1H3 / b4-3-,13-11- / t14-,15 +,18 +,20 + / s2

  • PIN :(2' S ,2'' R ,3'' S ,7'' R ,11'' R )‐ 3''‐甲基‐6‖‐甲基二烯基螺[雙(環丙烷)‐ 1,1':2',14''-四環[8.4.0.0 2,13 sup> .0 7,11 sup>]十四烷] -1''(10'' ),2,4'',8'',12''-戊烯

3。 $ \ ce {C20H18} $:169個字符

enter image description here

  • InChI = 1 / C20H18 / c1-11-3-4-12(2)17-16-9-15-13(11)5-6-14(15)18(17)20(16)10-19(20)7- 8-19 / h3-6,9,14,18H,2,7-8,10H2,1H3 / b4-3-,13-11- / t14-,18 +,20 + / s2

  • PIN :( 1'' S ,2' S ,4'' Z ,6'' Z ,10'' S )-6''-甲基-3''-亞甲基二螺[[雙(環丙烷)-1] ,1':2',14''-tetracyclo [8.4.0.0 2,13 sup> .0 7,11 sup>]十四烷] -2''(13'') ,4'',6'',8'',11''-戊烯

4。 $ \ ce {C20H18} $:171個字符

enter image description here

  • InChI = 1 / C20H18 / c1-11-3-4-12(2)17-16-9-15-13(11)5-6-14(15)18(17) )20(16)10-19(20)7-8-19 / h3-6,9,13,15H,1,7-8,10H2,2H3 / b4-3-,17-12 + / t13-, 15 +,20- / s2

  • PIN :(1'' S ,2' S ,4'' Z ,6'' Z ,10'' R ,11'' R )-6''-甲基-3''-甲基二烯基螺[雙(環丙烷)-1,1':2',14''四環[8.4.0.0 2,13 sup> .0 7,11 sup>]十四烷] -2,2''(13''),4'',6'',8''-戊烯

5。 $ \ ce {C20H18} $:172個字符

enter image description here

  • InChI = 1 / C20H18 / c1-11-3-4-12(2)17-16-9-15-13(11)5-6-14(15)18(17)20(16)10-19(20)7- 8-19 / h3-9,14-15,17-18H,2,10H2,1H3 / b4-3-,13-11- / t14-,15 +,17 +,18 +,20 + / s2 代碼>

  • PIN :(1'' S ,2' R ,2 '' S ,4'' Z ,6'' Z ,10'' R ,11'' S )‐ 6''‐甲基‐3»‐亞甲基二螺[[雙(環丙烷)‐1,1':2',14''‐四環[8.4.0.0 2,13 sup> .0 7,11 sup>]十四烷] -2,4'',6'',8'',12''-戊烯

Chakravarthy Kalyan
2018-01-09 19:40:39 UTC
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enter image description here ** 162個字符

enter image description here

  • PIN:(1'S,2'S ,6'S,7'R,12'S,14'S)-7'-methyldispiro [cyclopropane-1,8'-pentacyclo [7.5.1.02,6.02,14.012,15] pentadecane-13',1''-cyclopropane] -2, 2'',3',9'(15'),10'-pentaene
  • 我已使用MarvinSketch 17.28.0生成了銷。
mykhal
2018-09-26 20:02:54 UTC
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$ \ ce {C20H18} $ span>,290個字符

主要基於 Daniel Bonniot de Ruisselet idea,緊挨著末端環丙烯的兩個“成環的”環丙烷對也與雙環丁烷稠合,使其餘的甲基附著在末端環丙烯上,因此也允許更多的手性中心。

enter image description here

  • PIN :(1 S i>,1′ R ,1''' S ,1''''' R ,2'' S ,2'' ''' S ,3' S ,3''' S ,3''''' S , 4' R ,4''' R ,4''''' R )-2,3''''''-二甲基六螺並[環丙烷-1,2'-雙環[1.1.0]丁烷-4',1''-環丙烷-2'',2'''-雙環[1.1.0]丁烷-4''',1' ′′′-環丙烷-2′′′′′,2′′′′′′-雙環[1.1.0]丁烷-4′′′′′′′,1′′′′′′′-環丙烷] -2,2′′′ ′′′′-二烯

  • InChI = 1S / C20H18 / c1-7-3-15(7)9-10(15)17(9)5 -19(17)13-14(19)20(13)6-18(20)11-12(18)16(11)4-8(16)2 / h3-4,9-14H,5-6H2 ,1-2H3 / t9-,10 +,11-,12 +,13-,14 +,15 +,16 +,17-,18-,1 9 +,20-

  • CXSMILES: [H] [C @] 12C @([C @@] 11C = C1C)[C @ ] 21C [C @] 11 [C @] 2([H])[C @@] 1([H])[C @] 21C [C @@] 11 [C @@] 2([H]) [C @] 1([H])[C @@] 21C = C1C | c:6,32 |

  • 已壓縮並使用base64編碼的molfile:

      H4sIAGimq1sCA6WWTW7CMBCF9znFXKDW / PlvXSqxocsepIuev7YjGhFPGrBRhODl5WPmeWyxANy + fyixAGYOlChy5gv8vZYFOIB4AGwXtfftlXOGL0bEpX5Tp4EywJsXlxVT1dCVuwjv8Iiwr0bxjmLQSlEnXsSk8Bllq0VdDH66lvopySgl5ZpGpfh8kAs / VYtUSijPHuSCZ5TgAno56Yifp / xTy2ku0Qnls1xOKcmhKM92tFFm0t0oM7ObXNQUZ2d3o8zsRimU6FeK5zSYS92NjCuF6KAjfKWjcUoutQj / daSjHaWoLRd2iqSjHYkEnqW0NbJPqevzFO + yIK5ThwUzRml72p666ytr5JHvp9RjLtdXzjofmO67sa7WGGU76xKPpcttp9FOFVPV3r562SRor3pTDUfe0P9abDf23mSqudkNr61mi0BoqtRVViTDWyTqMyMxvXr34s5rq31mFID87hgvagKKvVq8fcfFyEbH1Lj7taAKMQhGZWUeeH08PE4fc6eWdll6tRC0J5R6fa + M + uewI2iNYtfFDeDj87L8Autmps9wCgAA 代碼> 

(根據MarvinSketch 18.23的所有數據,在矢量圖像編輯器中進行了圖像後處理;名稱為後處理的chem.SE和其他文本編輯器-RS斜體和撇號替換為素數。導入生成的InChI字符串會產生一些未指定的中心,因此我生成了ChemAxon SMILES,粘貼時會產生不同的立體化學,因此我還添加了壓縮的MDL molfile)

有人可以通過進一步修改擊敗300個字符嗎?



該問答將自動從英語翻譯而來。原始內容可在stackexchange上找到,我們感謝它分發的cc by-sa 3.0許可。
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