mszep
2019-12-09 05:36:36 UTC
Anton計算機是DE Shaw研究專門為分子動力學模擬而建造的。它們所實現的性能要比商品硬件快一個數量級，但是更廣泛的計算化學界似乎並沒有那麼多地使用它們。儘管存在這樣的事實，但在仿真時間尺度上的限制是使用仿真指導實驗的主要障礙，導致各種複雜的理論方法從相對較短的仿真軌跡中得出較長的時間尺度特性。
已閱讀關於已經有十多年曆史的Anton機器，我對為什麼它們沒有得到更廣泛的使用感到困惑。是因為它們太不靈活，沒有足夠的研究人員使用，對解決科學問題沒有幫助，還是我缺少其他原因？
也許便宜10倍的商品硬件便宜嗎？
DE Shaw甚至可以提供專用芯片嗎？
@theorist不，據我所知，但至少有一台機器可供研究人員請求時間：https://www.psc.edu/anton-rfp
您是否有證據表明計算機沒有得到廣泛使用？你能引用一些數字嗎？
根據這篇2016年的文章，“據任何人所知，在公司位於紐約的研究實驗室之外，匹茲堡超級計算機中心（PSC）上只有一台安東機器”（https://www.nextplatform.com/ 2016/02/04 / anton-sequel-for-custom-supercomputing /）。我還從這篇文章中收集到，DESRES保持了使其接近背心所需的技術，因此這是一個主要障礙。第二個可能的障礙是成本，如果DESRES從未將這項技術出售給任何其他人（已捐贈給PSC），我們就無法評估成本。
正如理論家所提到的，@BuckThorn並非如此。這是一種專門針對MD的特殊超級計算機。前500個超級壓縮程序中的一些也用於此目的，但用途更廣泛。
由於這個問題已經被瀏覽了43次，但仍然沒有答案，也許這可能是專門的計算化學物理學界感興趣的東西。例如，有一個關於材料模型交換的建議書：https：// area51.stackexchange.com / proposals / 122958 / materials-modeling？referrer = ODVjZmM2YzJmOTc0MzBkZDVkMTZmMTIzN2EyNmZmNTQyOWYyY2Y0YWFmNGYxNTQ2OTQzNmMwwIyYhhhBootZjMhWtYehhhOTZjMhWtYehhHOTZjMhWtYehhHOTZjMkw如果您認為它對您有用，也許您可以考慮支持它！
為什麼這是一個有效的問題，我認為這更多是商業/市場研究問題，而不是科學問題。同樣，一個數量級並不是什麼大問題。在過去的十年中，GPU輕鬆地以最快的速度躍升，基於GPU的工作站/集群的可用性和通用性大大提高。